Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snapc2Q91XA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc2Q91XA5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc2Q91XA5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms