Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prb1Q91X93 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prb1Q91X93 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prb1Q91X93 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prb1Q91X93 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms