Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q91WE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q91WE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q91WE4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q91WE4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q91WE4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q91WE4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q91WE4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q91WE4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q91WE4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q91WE4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q91WE4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q91WE4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q91WE4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q91WE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q91WE4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q91WE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q91WE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q91WE4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms