Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q91WD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q91WD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q91WD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q91WD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q91WD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q91WD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q91WD4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q91WD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q91WD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q91WD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q91WD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q91WD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q91WD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q91WD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q91WD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q91WD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q91WD4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q91WD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q91WD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q91WD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q91WD4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q91WD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q91WD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q91WD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q91WD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q91WD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q91WD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q91WD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q91WD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Q91WD4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q91WD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q91WD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q91WD4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q91WD4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q91WD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q91WD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q91WD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q91WD4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q91WD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q91WD4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q91WD4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q91WD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q91WD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms