Protein–RNA interactions for Protein: Q91W82

Ube2e2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e2Q91W82 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2e2Q91W82 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2e2Q91W82 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms