Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms