Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx9Q91VH2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx9Q91VH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx9Q91VH2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms