Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps3Q91VB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps3Q91VB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms