Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TraipQ8VIG6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TraipQ8VIG6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TraipQ8VIG6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TraipQ8VIG6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms