Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm4cQ8VCD7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4cQ8VCD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms