Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BbxQ8VBW5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BbxQ8VBW5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms