Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3b4Q8QZY9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b4Q8QZY9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms