Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf183Q8QZS5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf183Q8QZS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf183Q8QZS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf183Q8QZS5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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