Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hecw1Q8K4P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hecw1Q8K4P8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Hecw1Q8K4P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hecw1Q8K4P8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hecw1Q8K4P8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms