Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.2 ms