Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prpf39Q8K2Z2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf39Q8K2Z2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms