Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stn1Q8K2X3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stn1Q8K2X3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms