Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otud6bQ8K2H2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otud6bQ8K2H2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud6bQ8K2H2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms