Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek9Q8K1R7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms