Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem17Q8K0U3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem17Q8K0U3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms