Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip10Q8CJ53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip10Q8CJ53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip10Q8CJ53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip10Q8CJ53 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip10Q8CJ53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms