Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LgsnQ8CIX8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LgsnQ8CIX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms