Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phc3Q8CHP6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phc3Q8CHP6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc3Q8CHP6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms