Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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