Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Setd1bQ8CFT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Setd1bQ8CFT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Setd1bQ8CFT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Setd1bQ8CFT2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms