Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Bola3Q8CEI1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bola3Q8CEI1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bola3Q8CEI1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms