Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl11Q8CE33 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl11Q8CE33 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms