Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc87Q8CDL9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms