Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc158Q8CDI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc158Q8CDI6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc158Q8CDI6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms