Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrebrfQ8CDG5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrebrfQ8CDG5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrebrfQ8CDG5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms