Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vcpip1Q8CDG3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcpip1Q8CDG3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcpip1Q8CDG3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms