Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc5Q8CAL5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc5Q8CAL5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms