Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nhsl1Q8CAF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nhsl1Q8CAF4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nhsl1Q8CAF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms