Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc15Q8C9M2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc15Q8C9M2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350 ms