Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp3Q8C7U1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp3Q8C7U1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
N4bp3Q8C7U1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms