Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp20Q8C6M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp20Q8C6M1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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