Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rft1Q8C3B8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rft1Q8C3B8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rft1Q8C3B8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms