Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf428Q8C1M2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf428Q8C1M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf428Q8C1M2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms