Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rapgef5Q8C0Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef5Q8C0Q9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Rapgef5Q8C0Q9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
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Rapgef5Q8C0Q9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Rapgef5Q8C0Q9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Rapgef5Q8C0Q9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rapgef5Q8C0Q9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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