Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx1bQ8BX32 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Slx1bQ8BX32 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slx1bQ8BX32 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx1bQ8BX32 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms