Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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Pggt1bQ8BUY9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pggt1bQ8BUY9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Pggt1bQ8BUY9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pggt1bQ8BUY9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Pggt1bQ8BUY9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Pggt1bQ8BUY9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Pggt1bQ8BUY9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Pggt1bQ8BUY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pggt1bQ8BUY9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms