Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GorabQ8BRM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GorabQ8BRM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GorabQ8BRM2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms