Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Me3Q8BMF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Me3Q8BMF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Me3Q8BMF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms