Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Usp54Q8BL06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp54Q8BL06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp54Q8BL06 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms