Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcfc2Q8BKT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcfc2Q8BKT3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcfc2Q8BKT3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms