Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dupd1Q8BK84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dupd1Q8BK84 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms