Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcal1Q8BJL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcal1Q8BJL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcal1Q8BJL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms