Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GopcQ8BH60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GopcQ8BH60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GopcQ8BH60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms