Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q8BGC1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8BGC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BGC1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BGC1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BGC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BGC1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms