Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc3Q8BG54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc3Q8BG54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sptlc3Q8BG54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptlc3Q8BG54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms